公司间合同纠纷与员工无关，公司作为法人组织应承担责任。破产后债务由公司资产偿还，股东以其认缴的出资额或认购的股份为限对公司承担责任。公司终止后，股东有义务组织成立清算组织，依法处理企业财产并起诉主张债权。法定代表人行为违约或具有重大故意时，公司可以以其全部财产或追偿其损失。
法律分析
公司间合同纠纷不会影响到公司的员工。公司作为一家法人组织，其间的合同纠纷应由公司承担责任，而与员工无关。
一、公司倒闭法人没钱咋办？
依据我国公司法的规定，公司是属于法人组织，公司的民事责任应该由公司的出资承担，所以破产后债务由公司资产偿还。有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任；股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。公司终止后，该公司的股东有义务组织成立清算组织。清算组织依法处理企业财产，可以对外起诉主张债权并直接受偿，可以应诉并以清理所得的财产偿还债务。
二、公司法人跑了怎么处理
商业活动中公司法定代表人跑了的可以采取下列办法进行处理：
1、法定代表人行为违约的，则由公司以其全部财产对公司的债务承担责任；
2、法定代表人具有重大故意的，公司可以向其追偿。
法人是组织，不会自行参与商业活动，而一般由法定代表人参与民事活动。
拓展延伸
法人与子公司承担责任么？
子公司具有的法人人格。子公司是由公司出资设立的，具有法人的资格，子公司以其财产承担有限责任。子公司和母公司之间是被控股或者被控制经营管理的关系，除此之外，子公司的其他法律地位和母公司并没有任何的差别。
结语
这段话强调了公司间合同纠纷不会影响到公司的员工,而应由公司承担责任。同时,也提到了公司法人跑了的处理方式,包括可以采取下列办法进行处理:1、法定代表人行为违约的,则由公司以其全部财产对公司的债务承担责任;2、法定代表人具有重大故意的,公司可以向其追偿。最后,强调了法人是组织,不会自行参与商业活动,而一般由法定代表人参与民事活动。
法律依据
《公司法》第三条，公司是企业法人，有的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对公司的债务承担责任。
有限责任公司的股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任；股份有限公司的股东以其认购的股份为限对公司承担责任。
