对那些不符合土地利用总体规划和村庄集镇规划的宅基地超面积部分，或超过省(自治区、直辖市)规定标准的宅基地超占部分，可在土地登记簿和土地权利证事栏内注明超过标准的面积数，按照纳税流程进行纳税。
一、宅基地使用权人的权利与义务
1、宅基地使用权人的权利。
（1）权利人有权在宅基地上建造房屋和其他附属物。经法定审批程序取得宅基地使用权后，权利人有权在宅基地上建造住宅和其他附属物。这是宅基地使用权设立的主要目的。在宅基地以外的空地上，权利人还有权种植树木。
（2）权利人有权处分宅基地使用权。虽然我国禁止宅基地使用权的流转，但农村居民对宅基地上的房屋享有所有权并得自由处分。
2、宅基地使用权人的义务。
宅基地使用权人的义务主要是按照规定的用途使用宅基地。宅基地是用以建造村民住宅的，宅基地使用权人不得擅自将宅基地挪作他用，如利用宅基地建设厂房、旅店、酒店等。但考虑到我国农村的实际情况，农村村民如果只是利用自家住房附带地从事小规模、家庭式的生产经营活动，则不属于改变宅基地的用途。
二、宅基地使用权的申请条件
1、农村村民有下列情形之一的，可以申请设立宅基地使用权：
（1）因子女结婚等原因确需分户，缺少宅基地的；
（2）外来人口落户，成为本集体经济组织成员，没有宅基地的；
（3）因发生或者防御自然灾害、实施村庄和集镇规划以及进行乡村公共设施和公益事业建设，需要搬迁的。
2、农村村民有下列情形之一的，通常不予批准使用宅基地：
（1）非本集体的农村村民；
（2）已拥有一处达到规定标准面积的宅基地
（3）农村村民转让住房后，再申请宅基地的。
三、宅基地使用权与建设用地使用权的比较
宅基地使用权与建设用地使用权都是利用他人土地从事建造活动，且均可在集体土地上设立，但两者仍属性质不同的用益物权：
（1）权利主体的身份不同。宅基地使用权的主体只能是自然人，且限于集体经济组织的成员。建设用地使用权的主体基本上没有，自然人、法人和非法人组织均无不可。
（2）权利内容不同。例如，宅基地使用权不能转让、抵押或投资人股，而建设用地使用权可以转让、抵押及出资。
（3）取得方式不同。宅基地使用权的取得采取审批的方式，而建设用地使用权的取得通过出让或划拨方式。
（4）设立要件不同。宅基地使用权无须登记即可设立，而建设用地使用权以登记作为生效要件。
（5）是否有偿不同。宅基地使用权由本集体经济组织成员无偿取得，而以出让方式设立建设用地使用权时必须缴纳土地出让金。
（6）存续期限不同。宅基地使用权没有期限，而建设用地使用权有明确的期限，且不得超过法定的最高期限。
法律依据：
《中华人民共和国土地管理法》
第四十四条 建设占用土地，涉及农用地转为建设用地的，应当办理农用地转用审批手续。永久基本农田转为建设用地的，由批准。在土地利用总体规划确定的城市和村庄、集镇建设用地规模范围内，为实施该规划而将永久基本农田以外的农用地转为建设用地的，按土地利用年度计划分批次按照规定由原批准土地利用总体规划的机关或者其授权的机关批准。在已批准的农用地转用范围内，具体建设项目用地可以由市、县批准。
